公司注册资金减少变更的办理流程是：

1、公司召开董事会、股东会做出公司减资的决定；

2、编制公司的资产负债表及财产清单；

3、自股东会决定减资之日起十天之内通知债权人，并于三十日内在报纸上进行公告；

4、对公司减资后的注册资本出具验资报告；

5、起草公司债务清偿或者债务担保情况的说明；

6、修改公司章程；

7、公司进行变更登记申请。

根据《公司法》第一百七十七条规定，公司需要减少注册资本时，必须编制资产负债表及财产清单。

公司应当自作出减少注册资本决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，有权要求公司清偿债务或者提供相应的担保。